TIL 數量非常低,背景干擾訊號會丟失少量亞群,從而妨礙了免疫細胞群的分析實驗。腫瘤解離後 TIL 的分離大大提高了單細胞免疫分析靈敏度。
免疫療法已被證明具有臨床療效並具有巨大潛力,但只有一小部分患者可以體驗到實際的臨床益處。越來越有必要進行其他研究去改善實驗條件進而獲得有益的臨床結果。能夠穩定的分析抗腫瘤免疫力並監測治療對腫瘤微環境(包括腫瘤浸潤白細胞(TIL))的影響尤其重要。
但是,TIL 數量可能會非常低,並且當小的子群被背景訊號干擾時,它們可能會無法分析。在執行單細胞分析時,這尤其具有挑戰性。此外,單細胞分析的先決條件是存活率超過 80% 的無碎片單細胞懸液。圖 1 這裡,我們提供完整工作流程解決方案,包括組織存儲,腫瘤解離,死細胞去除和細胞分離可產生豐富的 T 和 B 細胞活力,從而顯著提高單細胞免疫族群分析結果。通過流式細胞儀對 TILs 進行免疫分型顯示 T 和 B 細胞占比低
在分離的大塊腫瘤樣品中,僅 14% 的細胞是白細胞。使用適當的 Gating 策略,白細胞被進一步細分為 T 細胞、 B 細胞、嗜中性粒細胞、嗜酸性粒細胞和 NK 細胞。
磁珠分選 TIL 可提高單細胞受體定序和免疫分析的靈敏度
將冷凍的腫瘤細胞解凍並去除死細胞後進行單細胞免疫族群分析。
樣品中活細胞的百分比從死細胞去除前的僅 26% 增加到 80% 以上。去除死細胞後,使用REAlease® CD4/CD8(TIL)MicroBeads 將 T 細胞提升到 80% 以上(圖3)。
TIL clonality 是通過單細胞受體定序來評估的,可通過未分離的細胞 (Bulk) 或分離的 TIL 進行。比較證明,TILs 的磁珠分離提高了 RNA 定序的分辨率,突顯出了克隆型,否則其表現差強人意或完全沒有表現出來。在圖 4 中,代表了通過 RNA 定序在分離的 TIL 群體(紫色)中確定的前 50 個 TCRβ(A)和 BCR(B)CDR3 克隆型,以及相應的細胞數。紅條表示在 Bulk 樣本中顯示相同 TCRβ(A)和 BCR(B)CDR3 克隆型的細胞數量。